Der er ikke én opfinder af spyware. Tværtimod menes det, at spyware opstod i slutningen af 1990'erne, da computerentusiaster begyndte at skabe software til at spionere på deres venner og familiemedlemmer. Disse tidlige spywareprogrammer var typisk simple tastetryksloggere eller skærmoptagelsesværktøjer, men de blev hurtigt mere sofistikerede. I begyndelsen af 2000'erne blev spyware et kommercielt produkt, og det blev hurtigt brugt af virksomheder til at spore medarbejderaktiviteter og af kriminelle til at stjæle personlige oplysninger.