- NTFS bruger et mere effektivt filallokeringssystem.** FAT32 bruger et klyngebaseret filallokeringssystem, hvilket betyder, at hver fil er gemt i sammenhængende klynger. Dette kan føre til spildplads, især hvis filen er lille, eller hvis der er mange små filer på disken. NTFS bruger på den anden side et filbaseret allokeringssystem, hvilket betyder, at hver fil er gemt i sin egen sammenhængende blok. Dette eliminerer spildplads og kan forbedre ydeevnen.

- NTFS understøtter større filstørrelser.** FAT32 har en maksimal filstørrelse på 4 GB. NTFS har på den anden side en maksimal filstørrelse på 16 TB. Dette gør NTFS til et bedre valg til lagring af store filer, såsom videoer og billeder i høj opløsning.

- NTFS er mere sikkert.** FAT32 understøtter ikke sikkerhed på filniveau. NTFS understøtter på den anden side filsikkerhed, som giver dig mulighed for at kontrollere, hvem der har adgang til dine filer. Dette kan hjælpe med at beskytte dine data mod uautoriseret adgang.

Samlet set er NTFS et bedre valg for de fleste brugere end FAT32. Det giver forbedret ydeevne, understøttelse af større filstørrelser og bedre sikkerhed.