Windows 2000 understøtter følgende filsystemer til organisering af en harddisk:

* FAT16: Dette er et ældre filsystem, der primært bruges til disketter og ældre harddiske. Det er begrænset i størrelsen på filer og partitioner, det kan understøtte.

* FAT32: Dette filsystem blev introduceret med Windows 95 og bruges stadig ofte til eksterne drev og USB -flashdrev. Det giver forbedret support til større filer og partitioner sammenlignet med FAT16.

* ntfs: Dette er det primære filsystem, der bruges af Windows NT-baserede operativsystemer, inklusive Windows 2000. Det giver mange fordele i forhold til FAT32, herunder:

* Support til meget større filer og partitioner

* Bedre sikkerhedsfunktioner, såsom filtilladelser og kryptering

* Forbedret ydelse, især for store filer og drev

* Support til journalføring, som kan hjælpe med at forhindre datatab i tilfælde af systemfejl

Windows 2000 kan læse og skrive til FAT16 og FAT32 -partitioner, men det kan kun skrive til NTFS -partitioner. Dette betyder, at du kan bruge eksterne drev formateret med FAT16 eller FAT32 med Windows 2000, men du bliver nødt til at formatere dem med NTFS, hvis du vil drage fuld fordel af dens funktioner.