De små opbevaringsområder inde i CPU'en, der indeholder tællerdata og instruktioner, kaldes registre. Registre bruges til midlertidigt at gemme data og instruktioner, der behandles af CPU'en. De består typisk af et lille antal transistorer, og de kan gemme et enkelt ord med data. Registrene er meget hurtige, og de kan tilgås direkte af CPU'en. Dette gør dem ideelle til lagring af data, der bliver brugt ofte, såsom den aktuelle programtæller eller stakmarkøren.