I de fleste computeroperativsystemer, inklusive Microsoft Windows og Apple macOS, er den primære museknap venstre knap. Når du klikker på et objekt med venstre museknap, udføres standardhandlingen for det pågældende objekt. For eksempel, hvis du klikker på en fil i en mappe, åbnes den. Hvis du klikker på et link i en webbrowser, fører det dig til den linkede side.

Højre museknap bruges typisk til at få adgang til kontekstafhængige menuer, som giver en liste over muligheder for at interagere med det valgte objekt. For eksempel, hvis du højreklikker på en fil i Windows Stifinder, vil du se en menu med muligheder som "Åbn", "Klip", "Kopier" og "Slet".

Nogle musemodeller har yderligere knapper, der kan programmeres til at udføre specifikke handlinger, såsom at starte programmer eller åbne bestemte mapper. Disse knapper er typisk placeret på siden af ​​musen og kan konfigureres ved hjælp af musedriversoftwaren.

Overordnet set er venstre museknap den primære knap, der bruges til at interagere med objekter på skærmen, mens højre museknap bruges til at få adgang til kontekstafhængige menuer og udføre yderligere handlinger.