Facebook-pixel sporer kun webstedstrafik, undtagen brugeraktiviteter i en mobilapplikation; i sådanne tilfælde bruges Facebook SDK. Derudover fanger den ikke data fra inkognito- eller private browsing-tilstande, da cookies er deaktiveret i sådanne indstillinger. Desuden, hvis brugere har annonce- eller cookie-blokering anvendt på deres webbrowsere, der specifikt målretter og forhindrer Facebook-pixels aktiviteter, kan pixelsporing ophøre helt, hvilket fører til unøjagtigheder i data.
