CONFIG.SYS og AUTOEXEC.BAT er to filer, der blev brugt i de tidlige dage af MS-DOS og Windows. CONFIG.SYS blev brugt til at konfigurere systemet, mens AUTOEXEC.BAT blev brugt til at køre alle programmer, der var nødvendige ved opstart.
CONFIG.SYS var en tekstfil, der var placeret i rodmappen på opstartsdrevet. Den indeholdt kommandoer, der blev brugt til at konfigurere systemet, såsom hukommelseshåndteringen, diskcachen og netværkskortet.
AUTOEXEC.BAT var også en tekstfil, der var placeret i rodmappen på opstartsdrevet. Den indeholdt kommandoer, der blev brugt til at køre programmer, der var nødvendige ved opstart, såsom kommandoprompten, filhåndteringen og antivirussoftwaren.
CONFIG.SYS og AUTOEXEC.BAT blev ikke længere brugt fra Windows ME. I stedet blev systemkonfigurationen gemt i registreringsdatabasen, og programmer, der var nødvendige ved opstart, blev tilføjet til mappen Startup.
