I MS-DOS kommunikerer en bruger med operativsystemet ved at udstede kommandoer .

Disse kommandoer indtastes typisk ved kommandoprompten, som normalt er repræsenteret af symbolerne "A>" eller "C>" efterfulgt af en blinkende markør.

Her er nogle eksempler på MS-DOS-kommandoer:

* dir: Viser filerne og mapperne i det aktuelle bibliotek.

* kopi: Kopierer filer fra et sted til et andet.

* del: Sletter filer.

* format: Formater en disk til brug.

* CD: Ændrer det aktuelle bibliotek.

* md: Opretter et nyt bibliotek.

* rd: Fjerner et bibliotek.

MS-DOS-kommandoer omtales ofte som dos-kommandoer eller kommandolinjekommandoer .