Der er et par måder at åbne en PDB-fil på.

Brug en teksteditor.

PDB-filer er almindelige tekstfiler, så du kan åbne dem med en hvilken som helst teksteditor, såsom Notesblok eller WordPad. Du vil dog ikke kunne se molekylets 3D-struktur i en teksteditor.

Brug en PDB-fremviser.

Der er mange forskellige PDB-fremvisere tilgængelige, både gratis og kommercielle. Nogle populære muligheder inkluderer:

- PyMOL: En gratis og open source PDB-fremviser med en bred vifte af funktioner.

- VMD: En gratis og open source PDB-fremviser, der er særligt velegnet til at visualisere store molekyler.

- Kimær: En kommerciel PDB-fremviser, der er kendt for sin brugervenlige grænseflade og omfattende funktionssæt.

For at åbne en PDB-fil i en PDB-fremviser skal du blot vælge menupunktet Filer> Åbn og gå til den PDB-fil, du vil åbne. PDB-fremviseren vil derefter indlæse filen og vise molekylets 3D-struktur.

Brug en webbrowser.

Der er også en række webbrowsere, der kan vise PDB-filer. Nogle populære muligheder inkluderer:

- RCSB Protein Data Bank: Den officielle hjemmeside for Protein Data Bank, som er vært for en stor samling af PDB-filer.

- Mol* Viewer: En gratis og open source webbaseret PDB-fremviser, der giver dig mulighed for at se 3D-strukturen af ​​molekyler i din webbrowser.

- JSmol: En gratis og open source Java-baseret PDB-fremviser, der giver dig mulighed for at se 3D-strukturen af ​​molekyler i din webbrowser.

For at åbne en PDB-fil i en webbrowser skal du blot kopiere og indsætte PDB-id'et i søgefeltet i webbrowseren. Webbrowseren vil derefter indlæse PDB-filen og vise molekylets 3D-struktur.