FLAC-filstørrelser varierer afhængigt af lydindholdet, men de er typisk større end MP3-filer. En gennemsnitlig FLAC-filstørrelse kan variere fra 20 til 50 megabyte (MB) pr. minut lyd, mens en MP3-fil af samme længde kan være omkring 3 til 5 MB. Derudover kan filstørrelsen på en FLAC-fil blive påvirket af samplinghastigheden, bitdybden og antallet af kanaler.