Det kan være farligt at redigere MS-DOS Config.sys-filen med et tekstbehandlingsprogram, fordi Config.sys-filen indeholder kritiske systemindstillinger, og eventuelle fejl eller forkert formatering kan forårsage, at systemet ikke starter op eller på anden måde fungerer dårligt. Tekstbehandlingsprogrammer er ikke designet specifikt til redigering af systemkonfigurationsfiler og kan introducere utilsigtede ændringer eller formateringsfejl, der kan have uforudsigelige konsekvenser.
For eksempel, hvis et tekstbehandlingsprogram ændrer afstanden eller indrykningen af en linje i filen Config.sys, kan det forstyrre den måde, operativsystemet fortolker indstillingerne på. Derudover kan tekstbehandlere indsætte skjulte tegn eller formateringskoder i filen, som ikke er kompatible med operativsystemet og kan forårsage fejl.
For at undgå disse risici anbefales det at bruge en teksteditor, der er specielt designet til redigering af systemkonfigurationsfiler, såsom MS-DOS Editor (Edit) eller en tredjeparts teksteditor med de relevante funktioner. Disse editorer sikrer, at filen er formateret korrekt og fri for fejl, der kan forårsage systemproblemer.