Linux-scriptfiler og Windows DOS-batchfiler ligner hinanden ved, at de begge er tekstfiler, der indeholder en række kommandoer, der udføres af operativsystemet. Der er dog nogle vigtige forskelle mellem de to.

* Syntaks :Syntaksen for Linux-scriptfiler og DOS-batchfiler er forskellig. Linux script filer bruger en Bourne shell syntaks, mens DOS batch filer bruger en DOS kommando syntaks.

* Indbyggede kommandoer :Linux-scriptfiler har et bredere udvalg af indbyggede kommandoer end DOS-batchfiler. Dette skyldes, at Linux er et mere kraftfuldt operativsystem end DOS.

* Miljøvariabler :Linux-scriptfiler kan få adgang til miljøvariabler, mens DOS-batchfiler ikke kan.

* Filhåndtering :Linux-scriptfiler har mere kraftfulde filhåndteringsmuligheder end DOS-batchfiler. For eksempel kan Linux-scriptfiler læse og skrive til filer, mens DOS-batchfiler kun kan læse fra filer.

* Fejlhåndtering :Linux-scriptfiler har mere robuste fejlhåndteringsmuligheder end DOS-batchfiler. For eksempel kan Linux-scriptfiler fange fejl og udskrive fejlmeddelelser, mens DOS-batchfiler ikke kan.

Generelt er Linux-scriptfiler mere kraftfulde og fleksible end DOS-batchfiler. Dog bruges DOS batchfiler stadig til nogle simple opgaver, såsom automatisering af gentagne opgaver.