Der er typisk ingen boot-partition, hvis du ikke bruger partitioner, i så fald skal du placere roden af ​​filsystemet i begyndelsen af ​​disken.

Hvis du beslutter dig for at bruge en enkelt partition til hele disken, kan du stadig have en separat opstartspartition. For at gøre dette skal du oprette en lille partition (ca. 512 MB i de fleste tilfælde) i begyndelsen af ​​disken og formatere den med et passende filsystem (typisk FAT32). Du skal derefter installere bootloaderen (såsom GRUB) på denne partition. Resten af ​​disken ville så være tilgængelig for rodpartitionen.

En anden mulighed er at bruge en partitionstabeltype, der understøtter partitionstyper over 4 primære partitioner, hvis din BIOS eller UEFI understøtter det. Ellers kan du enten bruge en LVM-opsætning eller bare opdele disken i partitioner direkte uden at bruge nogen partitionstabel ved at bruge fdisk uden at lave en partitionstabel (angiv blot startsektoren for hver partition). Denne opsætning kaldes DOS hybrid tilstand.