Windows XP understøtter følgende filsystemer:

* ntfs (nyt teknologisystem) :Det primære filsystem, der bruges af Windows XP, tilbyder funktioner som sikkerhed, kryptering, komprimering og journalføring for dataintegritet.

* FAT32 (Filallokering Tabel 32) :Et ældre filsystem, der var almindeligt i Windows 95/98 og tidligere. Det er enklere end NTFS og tilbyder begrænsede funktioner, men det er bredt kompatibelt med ældre operativsystemer og enheder.

* FAT16 (Filallokering Tabel 16) :Et ældre filsystem med begrænsede muligheder, hovedsageligt brugt til ældre enheder og disketter.

Mens Windows XP kan læse og skrive til forskellige andre filsystemer, er disse tre dem, de kan direkte formatere og bruge til sit eget lager.