En computer organiserer data på en lagerenhed ifølge et filsystem. FAT16, hvor FAT står for File Allocation Table, var en af ​​de tidligste Windows filsystemer. Windows 95 OEM Service Release 2 introducerede FAT32 filsystem, som fjerner mange af de begrænsninger af FAT16 . File Naming

filer i et FAT16-filsystemet kan højst have 8 tegn i deres navn og 3 tegn i deres forlængelse , såsom " example1.txt " . FAT32 fjerner denne begrænsning.
Fil og volumen størrelser

største filstørrelse som FAT16 kan støtte , er 2 GB. Dette er også den største mængde størrelse FAT16 kan støtte , hvilket gør FAT16 et dårligt valg for nutidens store lagringsenheder. FAT32 kan understøtte filer på op til 4 GB og volumen op til 8 TB , selvom Windows XP opretter kun volumener op til 32 GB. Filer større end 4 GB på Windows kræver NTFS filsystemet , som er tilgængelig fra Windows 2000.
Operating System og Device Support

Windows, Mac OS X , Linux og BSD al opbakning både FAT16 og FAT32. Da FAT filsystemer er enkle at implementere og bred opbakning , mange indlejrede enheder , såsom digitalkameraer og mobiltelefoner , brug FAT16 eller FAT32 som filsystem for deres flash storage . På denne måde kan enhver computer læse lagerenheden direkte.