Bioperl er et populært open source-projekt , der giver et omfattende bibliotek af moduler til at styre og manipulere data vedrørende biovidenskab. Forskere bidrager til Bioperl moduler, som er skrevet i programmeringssproget Perl. Mange forskere og ingeniører bruger Matlab , et højt niveau programmeringssprog udviklet af Mathworks for teknisk computing. MATLAB er populær i både den akademiske verden og industrien, fordi dens sprog giver brugerne mulighed for hurtigt at oprette kode til at analysere data , udvikle algoritmer og skabe visualiseringer . Frem for at lære Perl , kan du drage fordel af Bioperl funktioner ved blot at kalde Bioperl moduler fra MATLAB , og dermed udnytte din eksisterende viden om MATLAB foruden magt Bioperl moduler. Instruktioner
1
Installer Bioperl på dit system ved at følge anvisningerne passer til dit operativsystem på Bioperl websted ( Bioperl.org ) .
2
Type " perl ( » BioPerlModule ' )" i Matlab kommando vinduet, hvor " BioPerlModule " erstattes med navnet på den BioPerl modul, du ønsker at udføre.
3
For at udføre en BioPerl modul, der kræver input argumenter , type " perl ( ' BioPerlModule ', ' arg1 ', ' arg2 ' , ...) ", hvor " BioPerlModule " erstattes med navnet på den BioPerl modul og " ' arg1 ', ' arg2 ', ... " er erstattet med navnene på de variabler, du vil bruge som BioPerl modul argumenter.